Problembehebung

Das GUI speichert alle BIoklimadateien, Kontrolldateien, Simulationsergebnisse und Plots, die Sie in den Ordnern Ihres TMEnvironment produzieren. Sie werden beim nächsten Laden dieses TMEnvironments eingelesen. Das ist praktisch, bedeutet aber auch, dass das Einlesen immer länger dauert, je mehr und je grössere Simulationen mit grossen Bioklimata, Ergebnisdateien und Plots Sie haben. Versuchen Sie daher, die Menge der Informationen in einem TMEnvironment zu reduzieren.

• Bereinigen Sie Ihre Simulationen von Zeit zu Zeit. Löschen Sie diejenigen, die Sie nicht mehr benötigen, indem Sie auf das "x" der schwarzen Simulationsfelder klicken und alle Optionen "Simulationsergebnisse", "Simulationsplots" und "Simulationsstatusdateien" aktivieren.
• Bereinigen Sie Ihre Bioklimata in E, aber vorsichtig. Prüfen Sie zunächst in den Simulationen oder in den entsprechenden crtl-Dateien in C, welche Bioklimata noch benötigt werden und welche nicht.
• Wenn Sie ein völlig neues Projekt beginnen, legen Sie ein neues TMEnvironment an!

Installation, Starten, Beenden des GUI

• Falls es bei der Installation Probleme gibt, achten Sie darauf, dass Sie die neueste Version von R verwenden (mindestens 4.3.2).
• Aktualisieren Sie alle R-Pakete auf die neuesten Versionen, die für diese R-Version verfügbar sind. Das R-Paket "TreeMig" benötigt die folgenden 22 R-Pakete, die installiert werden müssen:
  "raster" "sf" "shiny" "ggplot2" "gridExtra"  "methods" "rlang" "ncdf4" "data.table"  "crayon"     "dplyr"   "tibble" "tidyr"   "gganimate" "latticeExtra" "rasterVis"  "slider"  "gifski"  "terra"  "shinyFiles"  "callr"  "pals"
• Um die grafische Benutzeroberfläche zu beenden, klicken Sie auf das rote Stoppzeichen über der Konsole von RStudio und schliessen Sie das inaktive (ausgegraute) Browserfenster oder die Registerkarte.
• Um das GUI neu zu starten, führen Sie die Zeilen default_files und runTreeMigShiny des Skripts "installAndRunTreeMigWrapperAndGUI.R" erneut aus.

Simulation

• Wenn Sie aus irgendeinem Grund keine Karte im GUI sehen, gehen Sie in einem anderen Tab Ihres Browsers zu map.geo.admin.ch, stellen Sie unten links das Koordinatensystem auf CH1903 / LV03, navigieren Sie zu Ihrem Untersuchungsgebiet, notieren Sie dessen Koordinaten unten links und oben rechts und geben Sie diese unter Crop Bioclimate in Latitude/Longitude start/end ein.
• Sehr oft entstehen Probleme durch unbeabsichtigtes Überschreiben der Bioklima-Dateien. Seien Sie also vorsichtig bei der Benennung und Verwendung der Bioklima-Dateien

Plotten

• Wenn Ihr Plot-Job mit der Fehlermeldung "Dimensions exceed 50 inches..." beendet wird, versuchen Sie es erneut mit "Limit Size off (red)" in den ggplot2 Arguments.
• Wenn sich in einem R(esultat)-Ordner sowohl NetCDF als auch .txt-Dateien befinden, werden beim Plotten die NetCDF-Dateien benutzt, auch wenn diese älter sind als die .txt-Dateien. Daher sollten Sie bei der Simulation entweder nur NetCDF-Output erzeugen, oder die alten NetCDF-Dateien löschen bzw. umbenennen.